Caso 1
Anual 2002 Normal 31 Mar 2003 Fecha para empezar el conteo del plazo de la prescripción.

Complementaria por ganar Juicio de PTU deducible se presento 5 May 2005
Aqui si procede solicitar la devolucion ya que los 5 años comienzan a partir de haber presentado la ultima complementaria,

No corresponde correr el plazo a partir de la declaración complementaria. Siempre el plazo comienza correr, a partir de la fecha de la presentación anual NORMAL (en el ISR), o en su defecto a partir del dia siguiente en que se debio haberse presentado, sin caer en el plazo de mora.

No comprendo, se aplica la devolución o se aplica una PTU como deducción.

Bueno, lo que sea, en el caso de la prescripción, se presentaó el 1 de Abril de 2008. Si no, se presentaron tramites de devolucion, en donde se este prorrogando el tiempo del plazo, mientras se da la resolucion del tramite de la solicitud de devolucion.

¿Estoy en lo correcto?

Al parecer, si se tiene la razon, si se aplicó la reclamación antes del 1 de abril de 2008. O en su defecto esta fecha se suspenderia y se prorrogaria la fecha anterior, si hay antes tramites negados por devolución. En donde esas solicitudes el contribuyente no se desiste en los tramites.

Caso 2
Anual 2003 Normal 30 Mar 2004

Aqui tambien ya pasaron los 5 años, ¿Que pasaria si presentara una complementaria ahorita....?

Ya prescribió aparentemente el 31 de Marzo de 2008. Si se presenta la complementaria. No cambiaria la fecha de prescripcion. La prescripcion no puede reinciarse el conteo. Se debe consultar el art 146 CFF. Darle un giro contrario, en lugar de tomar el sentido del gobierno reclama credito. Que el contribuyente reclame sus saldos a favor o pagos de lo indebido.

¿Comenzaria a correr nuevamente los 5 años...? o definitivamente ya no se puede hacer esto de recuperar este saldo.....?

No comenzaria nuevamente, pues el 146 CFF no lo contempla de esta forma.