tengo entendido como comentas, que si tomas la opción del antes articulo 4b ahora 5b, aplicas el factor de prorrateo al iva que se identifique para actividadades tanto gravadas como exentas (esto es el iva de los gastos) y a las inversiones.
Al iva de las operaciones identificadas con actividades gravadas (generalmente el iva de las compras) no les aplicas el factor ya que son acreditables al 100%.
iva de gastos 110
iva de inversiones 20
total 130
por factor de prorrateo 0.80
igual a 104
iva de compras 200
iva acreditable 304.
Por lo que si es necesario tener identificado el iva de los gastos, el de las inversiones y el de las compras.

Para mi es la mejor opción del factor del ejercicio inmediato anterior (art 5B) ya que el articulo 5 es muy fastidioso estar ajustando mes con mes.
pero tambien hay que considerar el beneficio economico de la persona fisica o moral.
Saludos.