La LISR es un compendio de disposiciones solo aplicable al ISR. No es es para COP

LIETU le aplica para IETU, no a ISR, no a COP

Las COP debe aplicarse la LSS, primordialmente el art 27 para la integracion de los salarios.
Pero previamente deben estar bien establecidas como se realizaron los pagos por salarios conforme a la LFT

Cada ley tiene su ambito y no es de aplicacion fuera de su ambito o su proposito. Es un error que es demasiado comun en considerar disposiciones de una ley para con otros fines que no les competen.

Siempre debe de establecerse un listado (algoritmico) paso de hechos que pasan en varios eventos.

1.- Pagos de salarios (se rige con el contrato laboral y la LFT, no con otras leyes que no sean laborales)
2.- Las retenciones salariales, (les aplica LSS, LISR, LINFONAVIT, segun el tipo de retencion, pero primero debe respetarse la LFT, pues se trata todavia de pagos de nominas)
3.- Integraciones de las COP (Se sigue unicamente LSS, no la LISR, no LIETU)

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En otro plano muy distinto, luego le corresponderia al patron deducir nominas

4.- Le aplica la LISR (para los efectos del ISR)
5.- Le aplicaria la LIETU para tributar IETU

No debe pretenderse cambiar el orden algorítmico. Saldrá mejor, si se procura respetar esta prelación.