Estimada Laura:

mi opinión al respecto es que definitivamente te conviene crear una Sociedad civil sobre todo si quienes la van a integrar es un grupo de médicos, te lo digo porque hay que recordar que los "servicios profesionales" de medicina, prestados a través de una persona física o sociedad civil están exentos del IVA, si creas una S.A. de C.V. la Ley de IVA te gravaría ésos servicios, en cuanto a lo que comentas de la distribución de anticipos a cuenta del remanente, creo que és lo más interesante de la sociedad civil ya que te permite distribuirles dinero a los socios antes e independientemente del resultado del ejercicio ya que éstos anticipos son deducibles y únicamente les retienes como si fueran empleados con el subsidio al 100% y sin aplicar el crédito al salario (recuerda que si distribuyes por ahí de $4,000 te resulta no retener) y les das su constancia, aquí es bueno decirte que entre más médicos haya, la figura es más noble ya que se distribuye entre más gente y no grava el impuesto, sin son pocos que cada uno se consiga unos dos socios de su familia y se metan en escritura constitutiva para que también puedan recibir dinero por concepto de anticipo de remanente distribuible.
En cuanto a la contabilidad es la misma de cualquier contribuyente de régimen general y con que vayas con el notario él te resuelve lo de la creación. si tienes dudas echame un grito cpdavid_con@hotmail.com