La NC es para bonificación, descuento o devoluciones, los cuales no aplican en este caso, lo que hizo tu proveedor es correcto. Tienes 2 opciones: 1, presentar complementaria del mes de pago cancelando el IVA acreditable. 2, hacer la cancelación del IVA acreditable en el mes de la cancelación, restando del IVA acreditable del mes, el IVA de esta transacción.
Lo importante no es saber, sino tener el teléfono del que sabe.