No entiendo porqué pero siempre se batalla en descargar el archivo en PDF, pero, en el caso de que solo ocupes el PDF para comparar los factores de Infonavit para ver si hay cambios te recomiendo la siguiente opcion:
Dentro de los archivos de la emisión hay un archivo txt que está dentro de unas carpetas llamadas 'CD COBRA' / 'TEMPO', el archivo que buscas se llama 'CDEBAS99', ese archivo txt contiene todo el detalle de los factores y tipos de factores de la emisión y lo puedes bajar antes que el PDF, solo lo tienes que copiar a un excel y usar la herramienta de 'texto en columnas'.
El unico detalle con el excel que descargas del IDSE es que en el caso de los créditos no te los detalla de manera exacta, te redondea las decimales; por ejemplo, puedes ver un caso en el PDF de factor descuento 15.3648 y en el excel te lo redondea a 15.36.