Buenos días

Mi duda concreta se da al momento en que recibo el pago con el que me liquidaron una factura expedida en el mes de diciembre 2013, la cual había sido pactada en una sola exhibición y al hacer la entrega de la mercancía solo me entregaron la mitad del total de la factura, comprometiéndose a liquidarla en unos días mas ( que se convirtieron en meses). Dicho pago lo recibí en el mes de junio, pero debo generar un comprobante cómo parcialidad o qué es lo más correcto hacer?
En INFOSAT me dicen que cancele mi factura CBB y genere una nueva en CFDI, esto no creo que sea lo mas conveniente, que comentario me pueden hacer al respecto.
Agradezco de antemano sus comentarios.

Pues que harías si fuera una factura 'normal' (de papel como antes, pues) o CFDI el que hayas expedido en 2013?

Lo hubieras expedido y si solo te pagan una parte, pues solo eso te pagaron y punto, lo tendrías por ahí en tu contabilidad (si es que así la llevas) como una cuenta por cobrar.
Desde mi punto de vista, así lo dejaría y cuando te lo paguen liquidas esa factura en tus controles y pagas los impuestos correspondientes a esa factura al acumular tus ingresos y tu IVA y se acabo el meollo del asunto.

No veo necesidad de expedir otra factura, ademas que te puedes meter en problemas con el cliente porque a lo mejor el si es persona moral ya mando al gasto tu factura. (ojo, al emnos que estés en la frontera y te hayan cambiado el IVA al 16%)

Muchas veces el camino mas fácil es el de la lógica, no hay que darle tantas vueltas al asunto.

Saludos!