Buen día.
En caso de los contribuyentes que venden productos con contenido calórico, cito lo siguiene de FISCALIA en uno de sus artículos.

Como puede observarse, las disposiciones del IVA expresamente establecen que otros impuestos forman parte de la base para el cálculo del IVA, por lo que expresamente el IEPS que se cause por la enajenación de ciertos bienes o la prestación de ciertos servicios, debe tomarse como base para el cálculo del IVA de esas operaciones.

Por ejemplo, un bien que se vende en $100 pesos y que causa un IEPS del 8% sobre el valor de la contraprestación, resulta en una base del IVA de $108 pesos. En este caso, el IVA causado es de $17.28 (108 * 16%), teniendo como precio al consumidor la cantidad de $125.28 ($100 valor + $8 de IEPS + $17.28 de IVA

La pregunta es.
Venta de un producto a $ 100.-
Para efectos del IVA la base es de $ 108.- (IEPS incluido)

Para ISR serían $ 100.- ??

Por su atención. gracias.

Que tal compañero, concuerdo con su opinión, en el caso planteado la base para ISR serían $100.00, el IEPS causado serían $ 8.00; para efecto de IVA en el caso de IEPS calórico no he encontrado yo ningún supuesto en el cuál se tenga tasa al 16% de IVA , por tanto no habría que hacer mayor modificación al cálculo (modificaciones como la mencionada por fiscalia), esto hubiera aplicado como originalmente estaba planteado el caso del chicle en el cuál:

Costo del paquete de chicles: $ 100.00
IEPS (como estaba originalmente*).. 8.00
IVA para gomas de mascar: 17.28
Costo total del paquete de chicles: $ 125.28

En este caso serían:

$100.00 de ingreso para ISR
$8.00 de IEPS calórico.
IVA a cargo: 17.28

Afortunadamente nos 'perdonaron' el IEPS para los chicles, aumentando solamente lo correspondiente al 16% de IVA, en vez de un 25%.

Espero le sea de utilidad mi comentario, reciba un cordial saludo.