Hola que tal:

En la emrpesa en la que yo laboraba, se cobraba un margen del 27% por los servicios.

Ahora bien, para que nosotros les paguemos solo nos ha mandado una relación en excel porque comentan no pueden expedir una factura ya que no es una prestación de servicios, sino solo el pago por la figura del mandato. El importe a pagar es el mismo que el del costo de los sueldos)

En que se basan para decirte que no te pueden facturar, acaso la filial que tienen en chile es parte de tu empresa, valla es una sucursal a la matriz en México, ejemplo:

sociedad patito sa de cv matriz
sociedad patito sa de cv sucursal brazil
sociedad patitio sa de cv sucursal chile... etc.

Si es así, en primer lugar no tienen porque cobrarte porque se supone q se trata de la misma empresa y por ende pueden hacer traspasos de personal, no?.. ahora si te lo cobran pues q te lo facturen con un margen; que te fundamenten lo dicho por ellos de que no se trata de prestacion de servicios, para mi si lo es, porque el trabajador aunque este trabajando en México, se supone que esta dado de alta en chile (desconozco las leyes chilenas) porque si no tons como le pagan?...

Supongo que tu hasta el momento que arreglara su documentacion q comentas no lo podias dar de alta o ya lo tenias dado de alta?, de no ser asi, olvidandonos un poco de que viene de chile, y pongamonos en el supuesto de que si una persona ajena a tu empresa viene trabaja en ésta, haciendo x cosa, como le pagarías?.. por SERVICIOS no? y le pedirías su recibo para comprobar dicha erogación.

Si no tienes la manera de comprobar con documentacion dicho gasto no lo vas a poder, mejor dicho, no lo debes de deducir..

Esta es una opinión de tu umilde servidor.

Salu2. que tengan un buen fin...