No nos indicas montos, pero al parecer dejaste de pagar algun concepto de impuestos y se cubrieron en exceso otros.

Deberan realizarse pagos complementarios para reflejarse los pagos de lo indebido. Y otros pagos para los no cubiertos, ni declarados o en su defecto declarados en menor cuantia.

Posteriormente, se aplicarian compensaciones por los pagos indebidos vs los impuestos no cubiertos, deteminandoseles los recargos y actualizaciones correspondientes

Por ultimo se presentarian los avisos por compensacion efectuadas.

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Si se declaro por error un importe a un concepto de impuesto equivocado, solamente se corrige el concepto apropiado, mediante la liga que CHAVALON te proporciona.

Los errores pudiesen ser:
1.- por tipo del impuesto mal informado
2.- periodo que no corresponde a lo que se manifesto
3.- ejercicio mal informado
4.- RFC y/o nombre del contribuyente, equivocadamente señalados.

Pero, se me hace que es mucho mas trabajo que esto, los errores son mayores a que se cometieron en este caso.