Hola buenas tardes.
Tengo la siguiente duda de los ingresos propios de la actividad que menciona el art. '111 REGIMEN DE INCORPORACION de la ley de I.S.R. son ingresos efectivamente pagados o ingresos facturados'
Ya que la autoridad tomo en cuenta ingresos facturados en el ejercicio que rebasan los dos millones de pesos en diciembre de 2017.
Y por esa razón me cambio de REGIMEN a Actividades empresariales.

Que tal Juana,

De primer instancia sí se consideran los ingresos devengados (facturados) de acuerdo a lo establecido en el artículo 90 primer párrafo y 111 primer párrafo de la LISR vigente; sin embargo, el artículo 90 en el mencionado párrafo menciona:

Artículo 90. Están obligadas al pago del impuesto establecido en este Título, las personas físicas residentes en México que obtengan ingresos en efectivo, en bienes, devengado cuando en los términos de este Título señale, en crédito, en servicios en los casos que señale esta Ley, o de cualquier otro tipo.

Como vez, se consideran devengados cuando la misma ley prevea esta condición.
Derivado de esto, en el artículo 111 sexto párrafo se menciona cuando se consideran obtenidos los ingresos:

Artículo 111. ... la utilidad fiscal del bimestre de que se trate se determinará restando de la totalidad de los ingresos a que se refiere este artículo obtenidos en dicho bimestre en efectivo, en bienes o enservicios...

Por tanto, sólo son los ingresos efectivamente cobrados en cualquier forma establecida en dicho artículo y como ves, no contempla la devengación. Pero debes saber que sí eres una de esas personas que a todos sus CFDI les incluía la leyenda 'Pago en una sola exhibición', probablemente por eso el SAT te consideró todos tus CFDI cobrados, pues estas dejando en claro que ya recibiste el pago por el CFDI que emites. De aquí la importancia de esta leyenda en los CFDI.

Aún así puedes acudir a la PRODECON si consideras que la autoridad incurrió en falta.

Ojala esta info sea de tu ayuda.

Saludos