1) se genero la linea de captura de las cuotas obrera patronal de marzo en tiempo pero no se pago por falta de liquidez.

Si intentan pagar con esa linea de captura no podran hacerlo.

2) se debe generar otra linea de captura con actualizacion y recargos para hacer su pago?

Afirmativo, asi lo indica la LSS y el CFF

3) como se pagaria la multa con otra linea de captura?

No se preocupe, el Seguro Social debera de enviarle otro formulario. Pero primero debe atender el requerimiento, debe entregar que ya liquido el adeudo de ese periodo que le solicitan que aclare. Despues de esta aclaracion, la autoridad le podra hacer la entrega de la multa o no hacer algo, segun su criterio y a lo que aporte como aclaraciones.

4) se puede solicitar la condonacion de la multa?

Si solicite su disminucion, el IMSS lo esta haciendo y ahi le condonaran parte de la multa, pero primero haga que el cumplimiento de obligacion sea aclarada, de lo contrario no podra hacer este paso.

5) si se solicita la condonacion de la multa solo se genera la linea de captura de las cuotas obrero patronal de marzo 2016?

Aqui ya no le generan una linea de captura, le generan un archivo SUA, debera llevar su memoria USB, e ir al banco a liquidar como un pago normal, le daran una hoja de condonacion y luego entregara una copia de ambos documentos, el pago del banco y de la condonacion y ahi termina el asunto. Lleve dinero en efectivo asi recurre al banco y liquida la multa de inmediato.

6) alguien tendra un machote para el escrito de condonacion de la multa que me puedan proporcionar al correo cruzsanta777@gamil.com.

No lo necesitara, en el IMSS se lo realiza, solo debe firmarlo el representante legal en ese instante que se lo hacen ellos, identificarse e ir al banco de inmediato, pagar, regresar a la entrega de que se cubre la multa con recargos y actualizacion pero ya con el monto condonado incluido en el calculo.

7) se puede pagar esta linea de captura en portal bancario, con transferencia, como se daria de alta al imss como beneficiario, o solo se hace como en el pago de impuestos al sat a la tesoreria de la federacion?

Supongo que ambos pagos pudieran hacerse mediante portal. al menos el de la contribucion omitida si es factible. Es la manera mas recomendable de hacerlo. Y la multa pues no lo hemos intentado, para no perder tiempo vamos al banco de la manera manual y presencial.