...el saldo de la cuenta de proveedores esta muy inflado debido a que por error duplicaba saldos el contador anterior, pero el error viene desde 2009...

Seguramente debe cancelarse en 2009 los asientos que localizaste como duplicados y volver hacer la declaracion anual de ese año.

...cual es el asiento de ajuste que me sugieren para dejar el saldo correcto al final de este año,...

Este año 2010, 'no se hacen' los registros contables. Los pueden hacer, pero no impactan a las cifras de 2010, sino a las del 2009 de manera retroactiva. Ahi se consideraron compras de mas, posiblemente costo de ventas deducido en exceso, inventarios quizas erroneos o en valores correctos. El efecto de las correcciones muy probablemente debe afectar a resultados del ejercicio 2009.

...las diferencias ya estan localizadas, solo tengo duda como realizar el asiento contable obviamente cargo la cuenta de proveedores para disminuirle el saldo pero contra que lo abono? ...

Dices que se duplicaron los asientos, tengo entendido que las compras se registran todas igual

c/o Compras o Almacen general (1)
c/o IVA acreditable pendiente por pagar
C/r Proveedores

Tu papel seria, observar si asi se hicieron dos veces, para eliminar 1 de los asientos duplicados o realizar un asiento a la inversa del anterior descrito o a la inversa de como se hallan realizado de manera efectiva.

(1) Siempre hay que analizar como quedo la valuacion del inventario finalmente, pues todos el diferencial que hay en compras o en el almacen general debe mandarse al Costo de ventas de lo vendido y este es el que habria deducido y quizas hasta perdidas en exceso se reportaron o incluso utilidades menores a las declaradas.